| 研究計畫 | 2018 | 利用 SNP 晶片進行台灣安格斯肉牛屠體性狀基因之分析 | 王佩華 | 2018年03月 ~ 2018年03月 |
| 研究計畫 | 2017 | 牛、羊傳染性疾病自主快速檢測技術之開發I, II | 王佩華 | 2017年07月 ~ 2018年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 建立李宋豬在生醫研究與醫藥檢測之技術平台-建立最低疾病迷你豬生產監控系統供生醫研究動物模式 | 王佩華 | 2014年01月 ~ 2014年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 臺灣穿山甲新微衛星標幟應用於域內及域外個體及族群遺傳結構分析 | 王佩華 | 2014年02月 ~ 2014年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 豬隻屠體與肉質性狀基因晶片檢測技術的發展 | 王佩華 | 2014年02月 ~ 2014年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 家禽育種、生產技術及品質改進-菜鴨微衛星標幟開發作為種原保護及經濟性狀關聯可行性之探討 | 王佩華 | 2014年01月 ~ 2014年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 家畜育種、生產技術及品質改進-建立眼球發育研究之實驗李宋豬動物模式 | 朱有田 | 2014年01月 ~ 2014年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 養豬產業結構調整計畫 六堆黑豬 | 朱有田 | 2014年01月 ~ 2014年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 墾丁國家公園台灣梅花鹿繁殖群基因多樣性保存及應用計畫 | 朱有田 | 2014年01月 ~ 2014年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 台灣水鹿跨域整合研究 | 朱有田 | 2014年01月 ~ 2014年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 藉由臺灣與菲律賓原生豬種之親緣關係研究鑑別豬隻生產力分子標記與南島語族遷徙（主持人） | 朱有田 | 2014年08月 ~ 2017年07月 |
| 研究計畫 | 2014 | 分析與建構台灣黑熊核心族群之永續力-藉由個體鑑別平臺與遺傳資料庫之建立進行台灣黑熊族群估算與遺傳結構研究 | 朱有田 | 2014年08月 ~ 2016年07月 |
| 研究計畫 | 2014 | 陽明山國家公園珍貴稀有動物麝香貓之調查 | 朱有田 | 2014年01月 ~ 2014年12月 |
| 研究計畫 | 2014 | 臺灣黑熊保育研究--比較不同螢光標定微衛星方式探討由排遺DNA進行臺灣黑熊與亞洲黑熊遺傳鑑別的可行性 | 朱有田 | 2014年01月 ~ 2014年12月 |